如何编写sed单线在每第三个字符后添加一个字符？

所以，我有一个看起来像这样的字符串：

AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA

我想将字符串分成3个字符的块，并用'+'号分隔。

AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UGA

我想和我的好朋友做到这一点sed。

我试过了

cat codons | sed -r 's/([A-Z]\{3\})/\1\+/g'

...没有成功。

我sed可以使用什么命令？

由于您不希望尾随+，因此可以执行以下操作：

fold -w3 | paste -sd+ -

也就是说，字符idth fold上的行以及与之对应的那3个字符行以精灵作为分隔符，实际上就像将每个换行符（但最后一个换成一个）都变成了。如果输入有多行，您将最终得到那些与a相连的行，该行可能是您想要的，也可能不是您想要的。3wpastes+d++

如果确实需要它sed，可以在以下位置删除结尾+：

sed 's/.../&+/g;s/+$//'

sed 's/.../&+/g'

为了让您的工作正常，您不需要转义{}符号：

sed -r 's/([A-Z]{3})/\1+/g'

这可能对您有用（GNU sed）：

sed 's/...\B/&+/g' file

如果不是必须使用sed，则可以使用Ruby。Ruby解释器ruby可以与sed和awk一起使用，只需运行带有-n使其在输入中进行迭代的选项即可。然后，可以通过将Ruby单行代码作为-e选项的参数添加到解释器中（该解释器告诉解释器解释参数-e而不是在文件中查找脚本）。

对于此特定问题，您可以使用以下单行代码（改编自https://stackoverflow.com/a/3184271/789593）：

ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'

用简单的语言

• 匹配scan(/.{3}|.+/)输入字符串中的任何3个字符或至少一个字符$_（在这种情况下，输入应来自标准输入），并将每个匹配项放入一个数组中，
• 将数组连接成一个字符串，并用'+'连接每个元素join("+")，
• 并打印它以换行符终止puts。

例如

echo "AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUG" | ruby -ne 'puts $_.scan(/.{3}|.+/).join("+")'
AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UG

请注意，它不会添加任何尾随的“ +”。