我有多个文件，这些文件具有相同的标头，并且在其下具有不同的向量。我需要将所有这些都连接起来，但是我只希望连接第一个文件的标头，并且我不希望将其他头连接在一起，因为它们都是相同的。
例如：file1.txt
<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B
C
file2.txt
<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
D
E
F
我需要输出
<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B
C
D
E
F
我可以在R中编写脚本，但是在shell中需要它吗？
Answers:
如果您知道如何在R中进行操作，那么一定要在R中进行操作。使用经典的Unix工具，这自然是在awk中完成的。
awk '
FNR==1 && NR!=1 { while (/^<header>/) getline; }
1 {print}
' file*.txt >all.txt
awk脚本的第一行与文件（FNR==1）的第一行匹配，除非它也是所有文件（NR==1）的第一行。当满足这些条件时，将while (/^<header>/) getline;执行表达式，这会使awk继续读取另一行（跳过当前行），只要当前行与regexp匹配即可^<header>。awk脚本的第二行将打印所有内容，但之前已跳过的行除外。
grep（例如sputnik的答案）。
head -n 10 file1.txt >output.txt && tail -q -n +11 file*.txt >>output.txt如果您有10条标题行）。另外，如果文件名中带有数字，请注意file9.txt在file89.txt和之间排序file90.txt。如果您的文件已编号喜欢file001.txt，...... files009.txt，files010.txt......，然后files*.txt会列出他们在正确的顺序。
awk 'FNR==1 && NR!=1{next;}{print}' *.csv
另一个解决方案，类似于和cat+grep上面的“ ”，使用tail和head：
将第一个文件的标头写入输出中：
head -2 file1.txt > all.txt- head -2获取文件的前两行。
添加所有文件的内容：
tail -n +3 -q file*.txt >> all.txt- -n +3使tail打印行从第3行到最后一行，
-q告诉它不要打印文件名为（read man）的标题，
>>将其添加到文件中，而不用覆盖它>。
并且确保您可以将两个命令放在一行中：
head -2 file1.txt > all.txt; tail -n +3 -q file*.txt >> all.txt或代替;放置&&在它们之间进行成功检查。
(head -2 file1.txt ; tail -n +3 -q file*.txt ) > all.txt或(head -2 file1.txt && tail -n +3 -q file*.txt ) > all.txt
尝试这样做：
$ cat file1.txt; grep -v "^<header" file2.txt
<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B
C
D
E
F
：
array=( files*.txt )
{ cat ${array[@]:0:1}; grep -v "^<header" ${array[@]:1}; } > new_file.txt
这是bash数组切片技术。
<header>文件中任何地方的行，而不仅仅是在开头。根据数据的不同，这里可能不是问题。
grep '^<header>' file1.txt >output.txt && grep -v '^<header>' file*.txt >>output.txt
该tail命令（至少在GNU上）具有跳过给定数量的初始行的选项。要从第二行开始打印，即跳过单行标题，请执行以下操作：tail -n+2 myfile
因此，要在Bash中保留第一个文件的两行标题而不是第二个文件：
cat file1.txt <(tail -n+3 file2.txt) > combined.txt或者，对于许多文件：
head -n1 file1.txt > combined.txt
for fname in *.txt
do
tail -n+3 $fname >> combined.txt
done
grep -v如sputnik所示，如果已知某个字符串出现在所有标题行中，但在其余所有输入文件中都没有，则这是一种更简单的方法。
较短（不一定更快）sed：
sed -e '3,${/^<header>/d' -e '}' file*.txt > all.txt这<header>...将从第3 行开始删除所有行，因此将保留第一个标头，并删除其他标头。如果标题中的行数不同，请相应地调整命令（例如，对于6行标题，请使用7代替3）。
如果标题中的行数未知，则可以这样尝试：
sed '1{
: again
n
/^<header>/b again
}
/^<header>/d
' file*.txt > all.txt
array =（* .txt）; head -1 $ {array [0]}> all.txt; tail -n +2 -q $ {array [@]：0} >> all.txt
假设您使用的文件夹带有.txt文件，且具有相同的标头，需要合并/串联，那么此代码会将txt文件全部合并到all.txt中，而只有一个标头。第一行（用分号分隔的行）收集所有要串联的文本文件，第二行将第一个txt文件的标头输出到all.txt中，最后一行将不带标头的所有文本文件连接起来（通过启动从第2行开始并置），并将其附加到all.txt。