mysqldump是否可以转储重现查询所需的数据库子集？

背景

我想提供重现select查询所需的数据库子集。我的目标是使我的计算工作流具有可重现性（就像在可重现的研究中一样）。

题

有没有一种方法可以将这个select语句合并到一个脚本中，该脚本将查询到的数据转储到新数据库中，以便可以将数据库安装在新的mysql服务器上，并且该语句可以与新数据库一起使用。除了已在查询中使用的记录以外，新数据库不应包含其他记录。

更新： 为澄清起见，我对查询结果的csv转储不感兴趣。我需要做的是转储数据库子集，以便可以将其安装在另一台计算机上，然后查询本身可以重现（并且可以针对同一数据集进行修改）。

例

例如，我的分析可能查询需要从多个（在此示例中为3个）表中进行记录的数据子集：

select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

mysqldump具有--where选项，可为给定表执行WHERE子句。

尽管无法mysqldump联接查询，但是您可以从每个表中导出特定的行，以便以后从联接中涉及从每个表中提取的每一行。

对于给定的查询，您将需要mysqldump三次：

首先，mysqld转储名称为（'fee'，'fi'，'fo'，'fum'）的所有table3行：

mysqldump -u... -p... --where="name in ('fee','fi','fo','fum')" mydb table3 > table3.sql

接下来，mysqldump从第一个mysqldump中获取具有匹配table3_id值的所有table2行：

mysqldump -u... -p... --lock-all-tables --where="table3_id in (select id from table3 where name in ('fee','fi','fo','fum'))" mydb table2 > table2.sql

然后，mysqldump从第二个mysqldump转储具有匹配table1_id值的所有table1行：

mysqldump -u... -p... --lock-all-tables --where="id in (select table1_id from table2 where table3_id in (select id from table3 where name in ('fee','fi','fo','fum')))" mydb table1 > table1.sql

注意：由于第二个和第三个mysqldumps需要使用多个表，因此必须使用--lock-all-tables。

创建新数据库：

mysqladmin -u... -p... mysqladmin create newdb

最后，将三个mysqldumps加载到另一个数据库中，然后尝试在新数据库中进行联接。

mysql -u... -p... -D newdb < table1.sql
mysql -u... -p... -D newdb < table2.sql
mysql -u... -p... -D newdb < table3.sql

在mysql客户端中，运行您的联接查询

mysql> use newdb
mysql> select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

试试看 ！！！

警告：如果索引不正确，第二个和第三个mysqldumps可能会永远占用！！！

以防万一，请索引以下各列：

ALTER TABLE table2 ADD INDEX (table1_id);
ALTER TABLE table2 ADD INDEX (table3_id);
ALTER TABLE table3 ADD INDEX (name,id);

我假设id是table3的主键。

我会考虑使用“输出文件”作为SELECT的一部分而不是mysqldump来解决此问题。您可以生成所需的任何SELECT语句，然后在结尾处附加“ INTO OUTFILE'/path/to/outfile.csv'...”，并附带用于CSV样式输出的适当配置。然后，您可以简单地使用“ LOAD DATA INFILE ...”语法将数据加载到新的模式位置。

例如，使用您的SQL：

select table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum')
INTO OUTFILE '/tmp/fee-fi-fo-fum.csv'
FIELDS TERMINATED BY ',' OPTIONALLY ENCLOSED BY '"'
LINES TERMINATED BY '\n'
; 

请记住，目标磁盘分区上将需要足够的可用存储空间。

mysqldump util具有--tables选项，可用于指定要转储的表。它使您可以指定表列表。

我不知道有任何更简单（自动）的方式。

对我有用的是：

mysqldump -u db_user -p db_name table_name --no_create_info \
--lock-all-tables --where 'id in (SELECT tn.id FROM table_name AS tn \
JOIN related_table AS rt ON tn.related_table_id = rt.id \
WHERE rt.some_field = 1)' > data.sql

从http://krosinski.blogspot.com/2012/12/using-table-join-with-mysqldump.html

您是否尝试过在mysql中使用quote函数？

SELECT CONCAT("insert into table4(id,level,name,levelt2) VALUES(",   quote(table1.id),   ",",    quote(table1.level),   ",",    quote(table2.name),   ",",    quote(table2.level),    ");") as q
       from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
       join table3 on table3.id = table2.table3_id
       where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

将以上内容另存为query.sql

cat query.sql|mysql --skip-column-names --raw > table4.sql

在MySQL中：

SHOW CREATE TABLE table1; -- use these two create statements
SHOW CREATE TABLE table2; -- to design table4's create statement
CREATE TABLE table4( .... );
INSERT INTO table4(id,level,name,levelt2)
SELECT table1.id, table1.level, table2.name, table2.level 
   from table1 join table2 on table1.id = table2.table1_id 
   join table3 on table3.id = table2.table3_id
   where table3.name in ('fee', 'fi', 'fo', 'fum'); 

在命令行上：

mysqldump mydb table4 |gzip > table4.sql.gz

在目标服务器上，设置〜/ .my.cnf

[client]
default-character-set=utf8

在目标服务器上导入

zcat table4.sql.gz | mysql

我为类似的问题写了一个小脚本，在这里是：https : //github.com/digitalist/mysql_slice

include ('queryDumper.php');


$exampleQuery="select * from information_schema.columns c1 
left join information_schema.columns c2 on 1=1 limit 1";

//define credentials
$exampleMysqli = new mysqli($host, $user, $password, $database);
$exampleResult=$exampleMysqli->query($exampleQuery);

//if  mysqlnd (native driver installed), otherwise use wrapper
$exampleData=fetchAll($exampleResult);
$exampleMeta=$exampleResult->fetch_fields();

/*
 * field content removal options
 * column name => function name in queryDumper.php, namespace QueryDumperHelpers
 * 
 * */

$forbiddenFields=array(
'password'=>'replacePassword', //change password -> md5("password")
'login'=>'replaceLogin', //change login vasya@mail.ru -> vasya@example.com
'comment'=>'sanitizeComment' //lorem ipsum or 
);


//get tables dump
$dump=(\queryDumper\dump($exampleData, $exampleMeta, $forbiddenFields));



$dropDatabase=true; //default false
$dropTable=true; //default false

$dbAndTablesCreationDump=\QueryDumperDatabaseAndTables\dump($exampleMysqli,$exampleMeta, $dropDatabase, $dropTable);

$databases=$dbAndTablesCreationDump['databases'];
$tables=$dbAndTablesCreationDump['tables'];
$eol=";\n\n";
echo implode($eol, $databases)."\n";
echo implode($eol, $tables).";\n";
echo "\n";

//consider using array_unique($dump) before imploding
echo implode("\n\n", $dump);
echo "\n";
?>

即你有这个查询：

SELECT * FROM employees.employees e1 
LEFT JOIN employees.employees e2 ON 1=1 
LIMIT 1; 

你得到了这个转储：

DROP DATABASE `employees`;

CREATE DATABASE `employees`;
CREATE TABLE `employees` ( /* creation code */ ) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1;

INSERT IGNORE INTO `employees`.`employees` VALUES ("10001","1953-09-02","Georgi","Facello","M","1986-06-26");

INSERT IGNORE INTO `employees`.`employees` VALUES ("10001","1953-09-02","Georgi","Facello","M","1986-06-26");