具有对数刻度和自定义间隔的直方图

我正在尝试用R的对数刻度生成R的直方图。目前，我正在：

hist(mydata$V3, breaks=c(0,1,2,3,4,5,25))

这给了我一个直方图，但是0到1之间的密度是如此之大（相差一百万左右），以至于您几乎无法分辨出其他任何条形。

然后我尝试做：

mydata_hist <- hist(mydata$V3, breaks=c(0,1,2,3,4,5,25), plot=FALSE)
plot(rpd_hist$counts, log="xy", pch=20, col="blue")

它为我提供了所需的内容，但底部显示的是值1-6，而不是0、1、2、3、4、5、25。它还将数据显示为点而不是条。barplot可以，但是我没有任何底轴。

直方图是穷人的密度估计值。请注意，在hist()使用默认参数的调用中，您获得的频率不是概率，,prob=TRUE如果需要概率则添加 到调用中。

至于对数轴问题，如果不希望对x轴进行转换，请不要使用'x'：

plot(mydata_hist$count, log="y", type='h', lwd=10, lend=2)

使您的柱数达到对数级-外观仍然有些不同，但可以进行调整。

最后，您还 hist(log(x), ...) 可以获取数据日志的直方图。

另一种选择是使用包ggplot2。

ggplot(mydata, aes(x = V3)) + geom_histogram() + scale_x_log10()

从您的问题尚不清楚，您是想要记录x轴还是记录y轴。使用条形图时，记录的y轴不是一个好主意，因为它们固定在零处，在记录时变为负无穷大。您可以通过使用频率多边形或密度图来解决此问题。

德克的答案是一个很好的答案。如果您想要外观像hist产生的效果，也可以尝试以下操作：

buckets <- c(0,1,2,3,4,5,25)
mydata_hist <- hist(mydata$V3, breaks=buckets, plot=FALSE)
bp <- barplot(mydata_hist$count, log="y", col="white", names.arg=buckets)
text(bp, mydata_hist$counts, labels=mydata_hist$counts, pos=1)

最后一行是可选的，它在每个栏的顶部下方添加值标签。这对于对数刻度图很有用，但也可以省略。

我还传递main，xlab和ylab参数来提供绘图标题，x轴标签和y轴标签。

运行hist（）函数而不制作图形，对数进行对数转换，然后绘制图形。

hist.data = hist(my.data, plot=F)
hist.data$counts = log(hist.data$counts, 2)
plot(hist.data)

它的外观应类似于常规直方图，但y轴将为log2 Frequency。

我整理了一个函数，它在默认情况下的行为与hist相同，但是接受log参数。它使用了其他海报的一些技巧，但又增加了一些技巧。hist(x)和myhist(x)外观是相同的。

原始问题将通过以下方式解决：

myhist(mydata$V3, breaks=c(0,1,2,3,4,5,25), log="xy")

功能：

myhist <- function(x, ..., breaks="Sturges",
                   main = paste("Histogram of", xname),
                   xlab = xname,
                   ylab = "Frequency") {
  xname = paste(deparse(substitute(x), 500), collapse="\n")
  h = hist(x, breaks=breaks, plot=FALSE)
  plot(h$breaks, c(NA,h$counts), type='S', main=main,
       xlab=xlab, ylab=ylab, axes=FALSE, ...)
  axis(1)
  axis(2)
  lines(h$breaks, c(h$counts,NA), type='s')
  lines(h$breaks, c(NA,h$counts), type='h')
  lines(h$breaks, c(h$counts,NA), type='h')
  lines(h$breaks, rep(0,length(h$breaks)), type='S')
  invisible(h)
}

读者练习：不幸的是，并非所有与历史有关的东西都与myhist兼容。不过，应该可以更轻松地解决此问题。

这是一个漂亮的ggplot2解决方案：

library(ggplot2)
library(scales)  # makes pretty labels on the x-axis

breaks=c(0,1,2,3,4,5,25)

ggplot(mydata,aes(x = V3)) + 
  geom_histogram(breaks = log10(breaks)) + 
  scale_x_log10(
    breaks = breaks,
    labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
  )

请注意，要在geom_histogram中设置中断，必须将其转换为与scale_x_log10一起使用