您的选择
order
从 base
arrange
从 dplyr
setorder
和setorderv
从data.table
arrange
从 plyr
sort
从 taRifx
orderBy
从 doBy
sortData
从 Deducer
在大多数情况下,除非没有依赖性很重要,否则应使用dplyr
或data.table
解决方案,在这种情况下,请使用base::order
。
我最近将sort.data.frame添加到CRAN包中,使其与类兼容,如下所述:
为sort.data.frame创建通用/方法一致性的最佳方法?
因此,给定data.frame dd,您可以进行如下排序:
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(taRifx)
sort(dd, f= ~ -z + b )
如果您是此功能的原始作者之一,请与我联系。有关公共领域的讨论在这里:http : //chat.stackoverflow.com/transcript/message/1094290#1094290
您还可以使用Hadley在上述线程中指出的arrange()
功能plyr
:
library(plyr)
arrange(dd,desc(z),b)
基准测试:请注意,由于存在很多冲突,因此我在新的R会话中加载了每个软件包。特别是,加载doBy包会导致sort
返回“以下对象已从'x(位置17)'屏蔽:b,x,y,z”,并且加载了sort.data.frame
由Kevin Wright或taRifx包覆盖的Deducer包。
#Load each time
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(microbenchmark)
# Reload R between benchmarks
microbenchmark(dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
中位数:
dd[with(dd, order(-z, b)), ]
778
dd[order(-dd$z, dd$b),]
788
library(taRifx)
microbenchmark(sort(dd, f= ~-z+b ),times=1000)
中位时间:1,567
library(plyr)
microbenchmark(arrange(dd,desc(z),b),times=1000)
中位时间:862
library(doBy)
microbenchmark(orderBy(~-z+b, data=dd),times=1000)
中位时间:1,694
请注意,doBy需要花费大量时间来加载程序包。
library(Deducer)
microbenchmark(sortData(dd,c("z","b"),increasing= c(FALSE,TRUE)),times=1000)
无法进行演绎器加载。需要JGR控制台。
esort <- function(x, sortvar, ...) {
attach(x)
x <- x[with(x,order(sortvar,...)),]
return(x)
detach(x)
}
microbenchmark(esort(dd, -z, b),times=1000)
由于进行了附加/分离,因此似乎与微基准测试不兼容。
m <- microbenchmark(
arrange(dd,desc(z),b),
sort(dd, f= ~-z+b ),
dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
uq <- function(x) { fivenum(x)[4]}
lq <- function(x) { fivenum(x)[2]}
y_min <- 0 # min(by(m$time,m$expr,lq))
y_max <- max(by(m$time,m$expr,uq)) * 1.05
p <- ggplot(m,aes(x=expr,y=time)) + coord_cartesian(ylim = c( y_min , y_max ))
p + stat_summary(fun.y=median,fun.ymin = lq, fun.ymax = uq, aes(fill=expr))
(线从下四分位数延伸到上四分位数,点是中位数)
考虑到这些结果并权衡简单性与速度,我必须arrange
在plyr
包装中表示赞同。它具有简单的语法,但几乎与基本R命令一样复杂,具有复杂的机加工。通常是出色的哈德利·威克姆(Hadley Wickham)的作品。我唯一的困扰是它打破了标准的R命名法,即通过调用排序对象sort(object)
,但是我理解为什么Hadley会因为上述问题中讨论的问题而采用这种方式。