R中的零膨胀负二项式混合效应模型

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是否有提供R中零膨胀负二项式混合效应模型估计的软件包？

我的意思是：

零充气，您可以在其中为零充气指定二项式模型，例如pscl包中的功能zeroinfl：
```
zeroinfl（y〜X | Z，dist =“ negbin”）
```
其中Z是零通胀模型的公式；
模型计数部分的负二项式分布；
指定的随机效果类似于软件包lme4的功能lmer。

我知道glmmADMB可以做所有的事情，除了不能指定零通货膨胀的公式（这只是一个截距，即Z仅为1）。但是还有其他软件包可以做到吗？

我将非常感谢您的帮助！

— 妮基塔·萨莫洛夫（Nikita Samoylov）
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我在寻找相同的东西。我认为glmmADMB是我想要的，但我无法使其运行。

— gregmacfarlane

我想知道ZIM或aod软件包是否可以完成您想做的事情？

— Graeme Walsh 2013年

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作为更新，Ben Bolker 的glmmTMB软件包支持零膨胀广义线性混合模型（ZIGLMM）。

— JWilliman '18

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我认为这是您需要的软件包：glmmADMB。我在这里下载了它：http : //otter-rsch.com/admbre/examples/glmmadmb/glmmADMB.html

但是我仍然无法运行它，因此我按照此链接中提供的说明进行操作，现在它可以正常运行http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/

希望这可以帮助！

— 罗西奥
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请注意，此程序包仅允许对模型的零通胀部分拟合常数项。

— user2390246 '18

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所述pscl包提供了一个零膨胀泊松模型。我认为它不能建立负二项式模型，但它可能是一个起点。链接的JSS文章还讨论了相关的程序包，这些程序包可能会使您找到所需的内容。

— 查理
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pscl软件包通过使用zeroinfl(..., dist = "negbin", ...)

— user2390246 '18

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根据您要尝试执行的操作，您可能需要查看aster软件包。Aster模型允许对具有不同概率分布的多个变量进行联合分析，并且最近已进行了更新以考虑随机效应。它们专为生活史分析而设计，将在您可以将响应分为具有不同分布的不同部分（例如生存=伯努利，繁殖=泊松）的情况下工作。他们可以通过将大多数零建模为bernoulli来处理“零通货膨胀”，并将其余响应建模为负二项式。

您将在此处找到大量文档：

http://www.stat.umn.edu/geyer/aster/

— 约翰·SG
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