问题:在升级之前,在Ubuntu14.04下,我只安装了默认的JRE和JDK,以及R 3.0.2(该Ubuntu版本的默认版本),并成功运行了R CMD javareconf
。
但是,由于升级到14.10并验证我具有最新的java7 JRE和JDK,因此尝试javareconf
通过以下转储运行失败:
cellocgw@cellocgw-Studio-1747:~$ sudo R CMD javareconf
Java interpreter : /usr/bin/java
Java version : 1.7.0_65
Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
Java compiler : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
trying to compile and link a JNI progam
detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/amd64/server -ljvm
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/../include -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c conftest.c -o conftest.o
In file included from conftest.c:1:0:
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/../include/jni.h:39:19: fatal error: stdio.h: No such file or directory
#include <stdio.h>
^
compilation terminated.
/usr/lib/R/etc/Makeconf:133: recipe for target 'conftest.o' failed
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program
JAVA_HOME : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
Java library path:
JNI cpp flags :
JNI linker flags :
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.
某物未安装或不在“应”放置的位置。我已经尝试了类似问题(进行更新等操作)中列出的大多数技巧,但是到目前为止,我还没有发现stdio.h
文件丢失是错误消息的问题。
@steeldriver听起来不太可能-我希望
—
Carl
stdio.h
在当前../include
目录中有一个文件
@steeldriver看起来您是正确的。看我的回答;如果您想发布更准确的答案,我们很乐意选择您的版本。
—
卡尔·威索夫特
<stdio.h>
标准的C库头文件,那么libc6-dev
我需要的包