Questions tagged «r»

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如何在自己的目录中安装R 3.3.1
这是一个有点重复的问题(请参阅如何在我的目录中安装R设置PATH),但是我确实遇到了新版本R的一些新问题。 我试图在自己的目录中安装R(R 3.3.1)的新版本。我遵循了以前的安装流程 但是我遇到了一个前所未有的问题。 ./configure --prefix=$HOME/Programme/R-3.3.1 ....... checking for zlib.h... yes checking if zlib version >= 1.2.5... no checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and headers are required 看来zlib版本太低,所以我安装了当前版本的zlib tar xvf zlib-1.2.11.tar.gz cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix=$HOME/Programme/zlib-1.2.11 make && make install 然后我尝试再次为R做配置,例如: ./configure --prefix=$HOME/Programme/R-3.3.1 --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/lib" CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include" 仍然我有同样的错误: …

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如何安装R的devtools和数字化?
我需要devtools,因为我需要功能install_github来在此处安装数字化 的非CRAN软件包。我安装了R sudo apt-get install r-cran-robustbase 正如terdon的回答所建议的那样,我没有立即安装R的软件包,但是我可以更正权限: sudo chmod 755 /usr/lib/R/site-library/ 我认为这是默认设置。然后,我必须按照rcs的答案建议进行操作,以成功安装devtools,tpoisot/digitize但只能使用 sudo apt-get install libssl-dev sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev R install.packages('httr') install.packages('git2r') install.packages('devtools') library(devtools) install.packages('readbitmap') install_github('tpoisot/digitize') 最后一条命令的输出可以是 Skipping install for github remote, the SHA1 (d16e28b9) has not changed since last install. Use `force = TRUE` to force installation 这样做install_github('tpoisot/digitize', …

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根据第二列排序,并从最高到最低列出
TGAAACATGCCTTTCACCTCCTGCCATGATTGTGAGGCCT 2 GTGTTGCCCAGGTTGGTTTCAAACTCAGCTCAAGTGATCT 1 GAGACTCCTTCAGGAGACTGGTCCCCTGTCCTCGCCTCTC 3 CATGTTCTCCTGGAAGCCATGTGAGGAAGGCACATCATGG 8 AAGGACATAATCTCATTACTTTTATGGCCGCATAGTATTC 4 AGAGGCAGTGTAAGTGAGGTAGTTGAAAGTATGGACTCTG 2 我想使用第二列将行从最高编号重新排列到最低编号 预期产量 CATGTTCTCCTGGAAGCCATGTGAGGAAGGCACATCATGG 8 AAGGACATAATCTCATTACTTTTATGGCCGCATAGTATTC 4 GAGACTCCTTCAGGAGACTGGTCCCCTGTCCTCGCCTCTC 3 AGAGGCAGTGTAAGTGAGGTAGTTGAAAGTATGGACTCTG 2 TGAAACATGCCTTTCACCTCCTGCCATGATTGTGAGGCCT 2 GTGTTGCCCAGGTTGGTTTCAAACTCAGCTCAAGTGATCT 1
-1 awk  python  sort  bioinformatics  r 
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