Questions tagged «pdb»

8
在C中解析蛋白质结构数据
我的背景是基因组学,但是最近我一直在研究与蛋白质结构有关的问题。我用C语言编写了一些相关程序,在此过程中从头开始构建了自己的PDB文件解析器。我不担心制作一个真正强大的解析器,我只是知道自己构建一个将是迫使自己真正理解PDB格式的最佳方法。 现在,我已经完成了这个过程,我正在寻找更坚固和成熟的东西。是否在C中实现了任何开源蛋白质结构库?我可以在Google上找到一些,但我以前从未听说过,而且它们似乎还不太成熟或稳定。一个稍微相关的问题:是否每个人都真的使用Python进行所有这些类型的计算吗?或自制代码? PS。我本质上是在寻找一个包含PDB文件解析器,用于计算键角,键长,扭转角,表面可访问表面积等的函数的库。
By using our site, you acknowledge that you have read and understand our Cookie Policy and Privacy Policy.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.