Questions tagged «r»

R是一种免费的开源编程语言和软件环境,用于统计计算,生物信息学和图形。

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在Ubuntu 13.04中找不到curl-config
我在R中安装软件包RCurl并收到错误 checking for curl-config... no Cannot find curl-config ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’ 我试图在Ubuntu上安装libcurl,但是它不能解决我的问题,这有一些依赖 sudo apt-get install libcurl4-gnutls-dev Some packages could not be installed. This may mean that you have requested an impossible situation or if you are using the unstable distribution that some required packages have not yet …

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安装最新版本的R-base
我一直未尝试安装r-base的最新版本(2.15.2)。显然,R包Rcpp不会为R版本2.14.1安装(为我安装的版本)。 我不确定在下面显示的更改安装尝试的方式/方式/位置。请注意,我正在使用ubuntu-12.04.1-server-i386。 当前安装的版本是R版本2.14.1(2011-12-22): $ sudo apt-get install r-base Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done r-base is already the newest version. 包含版本信息无济于事: $ sudo apt-get install r-base=2.15.1-5ubuntu1 Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done E: Version '2.15.1-5ubuntu1' for 'r-base' was not found …


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适用于Ubuntu的R 3.5.0
Ubuntu Xenial(16.04)的R 3.5.0安装包在ubuntu镜像站点上尚不存在。是否有其他方法可以将ubuntu xenial上的R更新到3.5.0?另外,是否有其他方法可以将R更新到3.5.0?

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在Ubuntu中安装R软件包的首选方法是什么?
我正在ubuntu中的R中进行安装,但是我对安装软件包的许多选项感到有些困惑。 传统方法是通过将它们安装在R内install.package()。但是,Ubuntu提供了使用进行安装的可能性apt-get。这很有趣,因为操作系统将保持软件包的更新。由于它们只有几个软件包,因此迟早会造成问题。我最终将通过传统方式安装软件包,以不同的方式安装它们,也许(?)这也会造成版本问题。 在Ubuntu中安装和保留R软件包的首选方法是什么?

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LaTeX和R的最佳设置是什么?
我不确定这是否是解决此问题的适当地点,因此我对此表示歉意。 我想从Windows切换到Ubuntu,或者Windows旁边至少有一个附加的操作系统。我以前曾尝试过Ubuntu,但从未真正喜欢过我发现的文本编辑器和R控制台。我需要做的主要事情是用R编程,编译程序包,编译C ++(使用Rcpp +内联)和编写LaTeX文档(使用Sweave)。 所以我想知道: Ubuntu是用于统计编程的良好Linux发行版吗? Ubuntu的文本编辑器是什么? 什么是适用于Ubuntu的好的R控制台/ IDE? 什么是Ubuntu的优秀LaTeX编辑器/发行版

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如何在Ubuntu 12.10上安装rgdal?
我正在努力rgdal在Ubuntu 12.10上安装库。 从R内安装会导致错误: 错误:找不到gdal-config找不到与GDAL一起分发的gdal-config脚本。如果尚未安装GDAL库,则可以从http://www.gdal.org/下载源代码 。如果已安装GDAL库,请确保gdal-config在您的路径中。尝试在shell提示符下键入gdal-config,看看它是否运行。如果不是,请使用:--configure-args ='-with-gdal-config = / usr / local / bin / gdal-config',并为其安装适当的值。 错误:软件包“ rgdal”的配置失败*删除“ /home/rdk/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/rgdal” install.packages中的警告:软件包“ rgdal”的安装具有非零退出状态 R-sig-Geo,这 两个 SE问题和其他网站向我指出了的要求libgdal1-dev。 但是当我尝试 须藤apt-get install libgdal1-dev 我最终收到另一条错误消息 无法安装某些软件包。这可能意味着您请求了一种不可能的情况,或者如果您使用的不稳定发行版中尚未创建某些必需的软件包或将其从“传入”中移出。以下信息可能有助于解决这种情况: 以下软件包具有未满足的依赖关系:libgdal1-dev:依赖:libgdal-dev但不会被安装E:无法纠正问题,您拿着损坏的软件包。 再次-当我尝试安装libgdal-dev另一个依赖项时出现错误 以下软件包具有未满足的依赖关系:libgdal-dev:依赖:libgeos-dev但不会被安装依赖:libspatialite-dev但不会被安装 再次尝试 libgeos-dev给出消息: Depends: libgeos-c1 (= 3.3.3-1.1) but 3.3.3-2~precise2 is to be installed E: Unable to correct problems, you …
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尝试安装R-Base时未满足的依赖关系
我从终端安装应用程序时遇到问题。这些是此问题的示例: ratanak @ ratanak-walker:〜$ sudo apt-get install httrack 正在阅读包装清单...完成 建立依赖树 正在读取状态信息...完成 您可能需要运行“ apt --fix-broken install”来更正这些问题。 以下软件包具有未满足的依赖性: httrack:取决于:libhttrack2(> = 3.48.24)但不会被安装 rstudio:取决于:libjpeg62,但是不会被安装 取决于:libgstreamer0.10-0,但无法安装 取决于:libgstreamer-plugins-base0.10-0但无法安装 推荐:r-base(> = 2.11.1)但不会被安装 E:未满足的依赖关系。尝试不使用任何软件包的“ apt --fix-broken install”(或指定解决方案)。 ratanak @ ratanak-walker:〜$ sudo apt-get安装r-base 正在阅读包装清单...完成 建立依赖树 正在读取状态信息...完成 您可能需要运行“ apt --fix-broken install”来更正这些问题。 以下软件包具有未满足的依赖性: r-base:取决于:r-base-core(> = 3.4.0-1xenial0),但不会安装 取决于:建议r(= 3.4.0-1xenial0),但不会安装 推荐:r-base-html,但是不会被安装 推荐:r-doc-html,但是不会被安装 rstudio:取决于:libjpeg62,但是不会被安装 …

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无法在Ubuntu 18.04中安装R软件包
问题 从16.04更新到Ubuntu 18.04后,无法安装一些R软件包(统计编程语言)。问题与共享库的使用有关。更确切地说:libcurl /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcurl.so.4: version `CURL_OPENSSL_3' not found (required by /home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/curl /libs/curl.so) 沙发手,我尝试过... ...使用来安装libcurl的早期版本 sudo apt-get install libcurl3,但是该过程中卸载了其他库,因此R无法使用。 错误输出 尝试安装名为“ forecast”的软件包时,例如: install.packages("forecast") installing to /home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/forecast/libs ** R ** data *** moving datasets to lazyload DB ** inst ** byte-compile and prepare package for lazy loading Error in dyn.load(file, DLLpath = …

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在Ubuntu 16.04中升级R版本3.3
我目前在Ubuntu 16.04 LTS上使用R版本3.2.3。我正在尝试在R中安装一个名为kma的软件包,该软件包需要devtools,data.table等软件包。当我尝试安装这些软件包时,我得到了: install.packages(c("devtools", "data.table", "reshape2", "dplyr")) Warning in install.packages : download had nonzero exit status Installing packages into ‘/home/varun/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2’ (as ‘lib’ is unspecified) Warning in install.packages : packages ‘devtools’, ‘data.table’, ‘reshape2’, ‘dplyr’ are not available (for R version 3.2.3) 如果R版本为3.3或更高版本,则这些软件包的安装没有任何问题。如何将我的R从当前版本3.2升级到版本3.3或更高版本。另外,我所有的软件包都在3.2中。我是否需要再次安装所有这些软件包? 希望尽快听到。 谢谢
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无法在Ubuntu Bionic Beaver中安装R 3.5.0(18.04)
我很高兴听到R开发人员最终通过他们的CRAN镜像发布了R 3.5并决定立即安装它。我添加了CRAN网站中提到的必需的PPA,deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/但是在运行命令后sudo apt-get update,我发现了以下警告。 expected bionic-cran35/ but got bionic 屏幕截图附在此处,以使内容更加清晰。 R_Bionic_installation_error 我太乐观了,继续执行下一个代码sudo apt-get install r-base,按预期,安装失败。错误显示在这里。 Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done Some packages could not be installed. This may mean that you have requested an impossible situation or if you are using the …

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一旦安装了geos库(C ++和C),然后尝试安装rgeos软件包(R),它将报告缺少geos-config!
知道R语言的rgeos软件包需要事先安装geos库,因此我在Ubuntu 12.04(32位)计算机上使用了突触安装程序安装了libgeos和libgeos-c1(3.2.2)。 然后,我尝试直接从R控制台安装rgeos,从某种意义上说,它发出的消息是找不到geos-config。输出如下: > install.packages("rgeos") Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’ (as ‘lib’ is unspecified) also installing the dependency ‘sp’ probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb) URL abierta ================================================== downloaded 861 Kb probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb) URL abierta …

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安装cURL库以满足对Ubuntu 12.04上R的依赖
我正在尝试安装curl库。它是RCurlR中软件包的依赖项,因此我必须安装它才能使R正常工作。我试过了: $ sudo apt-get install libcurl4-opensll-dev Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done E: Unable to locate package libcurl4-opensll-dev 我在下面的三个链接中发现了类似的问题。但是他们无助于解决我的困境。 需要libcurl(在Ubuntu论坛上) curl软件包损坏(在Ubuntu论坛上) 当前未安装程序“ curl” 我需要进行以下Rcurl工作:sudo apt-get install libcurl4-opensll-dev。

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无法在ubuntu 14.10下为R设置Java
问题:在升级之前,在Ubuntu14.04下,我只安装了默认的JRE和JDK,以及R 3.0.2(该Ubuntu版本的默认版本),并成功运行了R CMD javareconf。 但是,由于升级到14.10并验证我具有最新的java7 JRE和JDK,因此尝试javareconf通过以下转储运行失败: cellocgw@cellocgw-Studio-1747:~$ sudo R CMD javareconf Java interpreter : /usr/bin/java Java version : 1.7.0_65 Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre Java compiler : /usr/bin/javac Java headers gen.: /usr/bin/javah Java archive tool: /usr/bin/jar trying to compile and link a JNI progam detected JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include …
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