Questions tagged «c++»

在我的计算科学博士学位程序中，我们几乎只在C ++和Fortran中工作。似乎有些教授更喜欢另一种。我想知道哪个在某些情况下是“更好”的，还是一个在另一个方面要比另一个更好。

56 hpc  fortran  c++  languages 

使用vector<vector<double>>（使用std）形成高性能科学计算代码的矩阵类是一个好主意吗？ 如果答案是否定的。为什么？谢谢

36 hpc  c++ 

问题 我目前正在进行有限元Navier Stokes仿真，并且我想研究各种参数的影响。在输入文件中或通过命令行选项指定了一些参数。其他参数在Makefile中作为标志提供，因此每当我更改这些选项时，都必须重新编译我的代码。我很想获得一些有关系统地探索参数空间的好方法的建议。 是否有有用的C ++ / Python库/框架可以帮助解决此类问题？例如，发现boost.Program_options很有帮助，因为可以使用命令行参数来重载输入文件选项。我还看到有人使用工作文件非常有效地描述每种情况，并且一位同事建议将参数作为注释块写入vtu文件也可以工作。 也许根本不值得花很多时间在这上面吗？只是分散注意力和时间流失，最好只是通过测试过程中的蛮力和特设肌肉吗？ 一些想法 我目前主要是手工做事，遇到以下问题： 命名测试用例。我尝试将结果存储在以运行参数命名的文件夹中，并用下划线将其分隔，例如Re100_dt02_BDF1...。如果缩写太多，它们很快就会变长或难以阅读/难以理解。另外，实数参数包括.尴尬/丑陋的a。 记录运行数据。有时我希望看到结果写入终端并也保存到文本文件中。例如，来自StackOverflow的答案有些帮助，但解决方案似乎有点麻烦。 根据参数绘制数据。从各种日志文件中收集相关数据需要花费一些时间，然后我可以将其绘制到一个文件中，如果使用更好的系统，这也许会变得更容易。 记录有关数据的注释。检查结果后，我在文本文件中写了一些注释，但要使其与结果文件夹保持同步有时很困难。

29 software  finite-element  python  c++ 

MPI标准的3.0版本正式删除了C ++接口（先前已弃用）。尽管实现可能仍支持它，但MPI-3中的新功能没有MPI标准中定义的C ++接口。有关更多信息，请参阅http://blogs.cisco.com/performance/the-mpi-c-bindings-what-happened-and-why/。 从MPI中删除C ++接口的动机是，与C接口相比，它没有任何重要价值。除“ s / _ / :: / g”外，几乎没有区别，并且未使用C ++用户习惯的许多功能（例如，通过模板自动确定类型）。 作为参加MPI论坛并与许多实现了自己的MPI C函数C ++接口的C ++项目一起工作的人，我想知道MPI C ++接口的理想功能是什么。尽管我什么也不做，但我希望看到一个满足许多用户需求的独立MPI C ++接口的实现。 是的，我熟悉Boost :: MPI（http://www.boost.org/doc/libs/1_54_0/doc/html/mpi.html），但它仅支持MPI-1功能，并且序列化模型应为支持RMA极其困难。 我喜欢的一个MPI的C ++接口是Elemental（https://github.com/poulson/Elemental/blob/master/src/core/imports/mpi.cpp），所以也许人们可以提供一些专业知识方法。特别是，我认为MpiMap解决了一个基本问题。

28 c++  mpi 

假设我正在使用C ++编写科学代码。在最近与一位同事的讨论中，有人争辩说表达模板可能是一件很糟糕的事情，有可能使软件只能在某些版本的gcc上编译。据推测，这个问题影响了一些科学规范，正如《堕落》这个模仿中的字幕所提到的那样。（这些是我所知道的唯一示例，因此是链接。） 但是，其他人则认为，表达模板很有用，因为它们可以避免将中间结果存储在临时变量中，从而可以提高性能（如SIAM Journal of Scientific Computing的论文）。 我对C ++中的模板元编程一无所知，但我知道这是自动微分和区间算术中使用的一种方法，这就是我讨论表达式模板的方式。考虑到性能方面的潜在优势和维护方面的潜在劣势（即使这是正确的话），我什么时候应该在计算科学中使用C ++表达式模板，什么时候应该避免使用它们？

24 performance  c++  automatic-differentiation  interval-arithmetic 

打算教本科生一门名为“计算机编程入门”的课程。我有点困惑。在计算物理学中，科学家使用C / C ++或Python或Fortran，CUDA等。...现在是时候建立自己的基础了。我应该使用什么？我知道您可以在自己的生活中随时学习新的编程语言，但是对我来说，以后再详细介绍所有基本编程概念和OOP概念是一个明智的选择。

22 python  c++  computational-physics  languages 

我正在寻找书籍或文章，博客文章或任何已出版的一般材料，这些材料专门解决了科学计算中C ++现代功能（移动语义，STL，迭代器，惰性评估等）的使用。你能建议什么吗？ 我认为这些新功能将使编写高效的代码更加容易，但是我还没有找到真正的例子。我阅读的大多数参考文献都是关于C ++的一般用法的，并不包含科学计算的示例。因此，我正在寻找使用C ++现代功能的科学计算代码的示例（不一定是生产代码示例，而仅是教学示例，例如在数字食谱方面）。 请注意，我并不是在问使用这些功能的库。我在询问有关文章/书籍/等的内容，以解释如何在科学计算中利用这些功能。

22 c++  reference-request 

我正在寻找一个支持维度无关代码的C ++张量库。具体来说，我需要沿每个维度（最多3个）执行操作，例如，计算加权和。尺寸是模板参数（因此是编译时常数）。另一个限制是该库应该相对轻量级，因此本征/ Boost样式要比Trilinos / PETSc轻。 有什么建议么？ 注意：我查看了Eigen，并认为它几乎完全符合轮廓，如果它不限于2D张量。如果我对此感到误解，请纠正我。

20 c++  libraries  tensor 

假设我有一个函数，将多个浮点值（单或双）作为输入，进行一些计算，然后生成输出浮点值（也为单或双）。我主要使用MSVC 2008，但还计划使用MinGW / GCC。我在用C ++编程。 以编程方式测量结果中有多少错误的典型方法是什么？假设我需要使用任意精度库：如果我不关心速度，那么最好的此类库是什么？

20 floating-point  c++ 

我想从头开始开发并行科学计算软件。我想开始使用哪种语言。该程序涉及将数据读/写到txt文件中，并并行进行大量计算，并具有许多LU分解和使用稀疏线性求解器的功能。我在考虑的候选解决方案是带有OpenMP或协同阵列的Fortran 2003/2008，带有openmp cilk +或TBB的C ++，python。任何其他有文件记录的建议，我们都欢迎！我非常了解C，Fortran和Java（按此顺序）。我已经在python中完成了一些脚本编写工作，但是基本的东西。 我知道fortran很快，但是很难维护和并行化。据说C ++运行缓慢，除非您使用外部库等我喜欢的Python，但是在其上编写全面的工业级软件是否现实？ 该软件需要能够处理大量数据并通过科学计算有效。性能至关重要。 对于背景，我已经有一个用Fortran编写的工作软件。许多人参与了很多年的开发，并且代码真的很脏。维护和并行化代码被证明是一场噩梦，我正在考虑其他选择。 佩特罗斯

18 python  hpc  c++  fortran  simulation 

我正在开发代码，以使用流体中存在的生物物质来模拟流体流动。这涉及到标准的Navier-Stokes方程以及一些其他的生物学模型。有许多参数/常量。 我已经编写了处理主要计算的函数，但是我遇到的一个问题是这些计算所依赖的大量常量/参数。将10-20个参数传递给一个函数似乎很麻烦。 一种替代方法是使所有常量成为全局变量，但是我知道这在C ++中是不受欢迎的。 处理一个功能的许多输入的标准方法是什么？我应该构造一个结构并通过它吗？ 谢谢

17 c++ 

C ++语言通过模板提供通用的编程和元编程。这些技术已进入许多大型科学计算程序包（例如MPQC，LAMMPS，CGAL，Trilinos）。但是，它们在整体开发时间和可用性上是否具有相等或充分的效率，它们实际上对科学计算做出了哪些贡献，这些价值超出了诸如C或Fortran之类的非通用，非元语言。 给定科学计算任务，通过C ++模板进行的通用和元编程是否已证明通过任何易于理解的基准（代码行，人工工作等）衡量的生产率，表达力或可用性方面的改进？相应地，将C ++模板用于通用编程和元编程会带来哪些风险？

17 performance  c++  programming-paradigms 

我最不喜欢MPI的一点是处理数据类型（即数据映射/掩码），因为它们与面向对象的C ++不太吻合。boost::mpi仅在其网站上支持MPI 1.1： boost :: mpi是标准消息传递接口的C ++友好接口……Boost.MPI可以使用Boost.Serialization库为用户定义的类型构建MPI数据类型。 有没有人boost::mpi对严肃的科学计算有任何经验？你会推荐吗？您是否遇到了任何问题（扩展问题，编译器问题，错误，未实现的功能，需要某些mpi 2.2功能）？ 您能否评论使用boost::mpi而不是使用C ++中的MPI C实现？可以同时使用两者吗（可以的话，使用boost :: mpi，在其他地方使用C-MPI）？ 您知道使用的任何大型科学代码boost::mpi吗？

16 hpc  c++  mpi 

许多计算科学较为著名的C ++库如征，Trilinos和deal.II使用标准的C ++模板库头对象std::complex<>，表示复杂的浮点数。 在Jack Poulson 回答有关默认构造函数的问题时，他指出，“出于多种原因” 他std::complex在Elemental中具有自己的实现。那是什么原因 这种方法的优点和缺点是什么？

14 linear-algebra  c++  programming-paradigms  complex 

函数具有靠近奇点X = 0。但是，可以提高奇点：对于x = 1，应该使f （x ）= 1，因为 e x = ∑ k = 0 x kf:x↦(ex−1)/xf:x↦(ex−1)/xf \colon x \mapsto (e^x-1)/xx=0x=0x = 0x=1x=1x = 1f(x)=1f(x)=1f(x) = 1 因此 （ex−1）/x=∑k=1x k − 1ex=∑k=0xkk!ex=∑k=0xkk! e^x = \sum_{k=0} \frac{x^k}{k!} 然而，形式（ëX-1）/X不仅在没有定义X=0，它也是在该点附近的数值不稳定; 为了在数值上评估非常小的x的f（x），可以使用泰勒展开，即上述幂级数的截断。(ex−1)/x=∑k=1xk−1k!(ex−1)/x=∑k=1xk−1k! (e^x - 1)/x = \sum_{k=1} \frac{x^{k-1}}{k!} (ex−1)/x(ex−1)/x(e^x-1)/xx=0x=0x = 0f(x)f(x)f(x)xxx 问：函数是否有名称？换句话说，这是一个普遍的问题吗？fff 问：是否有人知道可以很好地处理这种情况的C / …

13 c++  c