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有限元矩阵稀疏结构的计算
问题:有哪些方法可以准确有效地计算有限元矩阵的稀疏结构? 信息:我正在使用Poerson压力方程求解器,使用Galerkin方法和二次Lagrange基础(用C编写),并使用PETSc进行稀疏矩阵存储和KSP例程。为了有效地使用PETSc,我需要为全局刚度矩阵预先分配内存。 目前,我正在做一个模拟程序集,以估计每行非零的数量,如下所示(伪代码) int nnz[global_dim] for E=1 to NUM_ELTS for i=1 to 6 gi = global index of i if node gi is free for j=1 to 6 gj = global index of j if node gj is free nnz[i]++ 但是,这会高估nnz,因为某些节点之间的交互可能会在多个元素中发生。 我已经考虑过尝试跟踪发现的i,j交互,但是我不确定如何在不使用大量内存的情况下执行此操作。我还可以遍历节点,并找到以该节点为中心的基本功能的支持,但是随后我必须搜索每个节点的所有元素,这似乎效率很低。 我发现了这个最近的问题,其中包含一些有用的信息,特别是来自Stefano M的,他写了 我的建议是应用一些图论概念,以python或C语言实现它,即将矩阵中的元素视为图的边并计算邻接矩阵的稀疏结构。列表列表或键字典是常见的选择。 我正在寻找有关此的更多详细信息和资源。我承认我不太了解图论,而且我对所有可能有用的CS技巧都不熟悉(我从数学的角度出发)。 谢谢!